Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL48Q96GC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL48Q96GC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL48Q96GC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL48Q96GC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL48Q96GC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL48Q96GC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms