Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUB1Q96FW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUB1Q96FW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB1Q96FW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB1Q96FW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms