Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EDAQ92838 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDAQ92838 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDAQ92838 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDAQ92838 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDAQ92838 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDAQ92838 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDAQ92838 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDAQ92838 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDAQ92838 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDAQ92838 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDAQ92838 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDAQ92838 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDAQ92838 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDAQ92838 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDAQ92838 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDAQ92838 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDAQ92838 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDAQ92838 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EDAQ92838 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EDAQ92838 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDAQ92838 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDAQ92838 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDAQ92838 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDAQ92838 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDAQ92838 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDAQ92838 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDAQ92838 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDAQ92838 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDAQ92838 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDAQ92838 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDAQ92838 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDAQ92838 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDAQ92838 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDAQ92838 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDAQ92838 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDAQ92838 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDAQ92838 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDAQ92838 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDAQ92838 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDAQ92838 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDAQ92838 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDAQ92838 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDAQ92838 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EDAQ92838 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDAQ92838 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDAQ92838 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDAQ92838 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDAQ92838 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDAQ92838 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDAQ92838 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDAQ92838 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDAQ92838 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDAQ92838 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDAQ92838 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDAQ92838 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDAQ92838 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDAQ92838 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EDAQ92838 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDAQ92838 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EDAQ92838 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDAQ92838 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDAQ92838 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDAQ92838 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDAQ92838 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDAQ92838 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDAQ92838 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDAQ92838 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDAQ92838 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDAQ92838 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDAQ92838 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EDAQ92838 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDAQ92838 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDAQ92838 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDAQ92838 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EDAQ92838 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDAQ92838 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDAQ92838 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDAQ92838 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EDAQ92838 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDAQ92838 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDAQ92838 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms