Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf54Q8WWF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1orf54Q8WWF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf54Q8WWF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1orf54Q8WWF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C1orf54Q8WWF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1orf54Q8WWF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1orf54Q8WWF1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf54Q8WWF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C1orf54Q8WWF1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C1orf54Q8WWF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1orf54Q8WWF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
C1orf54Q8WWF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf54Q8WWF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms