Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG1Q8WTW3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG1Q8WTW3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG1Q8WTW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG1Q8WTW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG1Q8WTW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COG1Q8WTW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG1Q8WTW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG1Q8WTW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms