Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS4Y2Q8TD47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS4Y2Q8TD47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4Y2Q8TD47 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4Y2Q8TD47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS4Y2Q8TD47 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS4Y2Q8TD47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms