Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF248Q8NDW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF248Q8NDW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF248Q8NDW4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF248Q8NDW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF248Q8NDW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms