Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC63Q8NA47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC63Q8NA47 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC63Q8NA47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC63Q8NA47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC63Q8NA47 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC63Q8NA47 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms