Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM1Q8IZ96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMTM1Q8IZ96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM1Q8IZ96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMTM1Q8IZ96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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