Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCMQ8IYD8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCMQ8IYD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCMQ8IYD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCMQ8IYD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCMQ8IYD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCMQ8IYD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCMQ8IYD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCMQ8IYD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCMQ8IYD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCMQ8IYD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms