Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR5

TMTC1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC1Q8IUR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC1Q8IUR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC1Q8IUR5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMTC1Q8IUR5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMTC1Q8IUR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMTC1Q8IUR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMTC1Q8IUR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMTC1Q8IUR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMTC1Q8IUR5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms