Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms