Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACUL1Q86Y37 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACUL1Q86Y37 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACUL1Q86Y37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACUL1Q86Y37 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACUL1Q86Y37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACUL1Q86Y37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACUL1Q86Y37 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms