Protein–RNA interactions for Protein: Q86VD7

SLC25A42, Mitochondrial coenzyme A transporter SLC25A42, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A42Q86VD7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A42Q86VD7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A42Q86VD7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC25A42Q86VD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A42Q86VD7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A42Q86VD7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A42Q86VD7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms