Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RBBP6Q7Z6E9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RBBP6Q7Z6E9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RBBP6Q7Z6E9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RBBP6Q7Z6E9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms