Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD3Q7L5L3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDPD3Q7L5L3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDPD3Q7L5L3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD3Q7L5L3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms