Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMR5

TMPRSS11A, Transmembrane protease serine 11A, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11AQ6ZMR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS11AQ6ZMR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPRSS11AQ6ZMR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11AQ6ZMR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS11AQ6ZMR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS11AQ6ZMR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms