Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTA2Q6UW10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTA2Q6UW10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA2Q6UW10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFTA2Q6UW10 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFTA2Q6UW10 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms