Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
KCNV1Q6PIU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNV1Q6PIU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNV1Q6PIU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNV1Q6PIU1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KCNV1Q6PIU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNV1Q6PIU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNV1Q6PIU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KCNV1Q6PIU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNV1Q6PIU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms