Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
EDC4Q6P2E9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
EDC4Q6P2E9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
EDC4Q6P2E9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
EDC4Q6P2E9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EDC4Q6P2E9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
EDC4Q6P2E9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EDC4Q6P2E9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
EDC4Q6P2E9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
EDC4Q6P2E9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
EDC4Q6P2E9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EDC4Q6P2E9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EDC4Q6P2E9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EDC4Q6P2E9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms