Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR4

OTP, Homeobox protein orthopedia, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTPQ5XKR4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTPQ5XKR4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTPQ5XKR4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTPQ5XKR4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTPQ5XKR4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTPQ5XKR4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTPQ5XKR4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTPQ5XKR4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTPQ5XKR4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms