Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM27D1Q5T7N8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM27D1Q5T7N8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM27D1Q5T7N8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM27D1Q5T7N8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27D1Q5T7N8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM27D1Q5T7N8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms