Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms