Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP2Q5QGT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP2Q5QGT7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP2Q5QGT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTP2Q5QGT7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTP2Q5QGT7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP2Q5QGT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTP2Q5QGT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP2Q5QGT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP2Q5QGT7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTP2Q5QGT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP2Q5QGT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms