Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FFAR4Q5NUL3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FFAR4Q5NUL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FFAR4Q5NUL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FFAR4Q5NUL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FFAR4Q5NUL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms