Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBOX4Q5JUW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBOX4Q5JUW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBOX4Q5JUW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRBOX4Q5JUW0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms