Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB3PQ58FF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HSP90AB3PQ58FF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HSP90AB3PQ58FF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB3PQ58FF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB3PQ58FF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HSP90AB3PQ58FF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB3PQ58FF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB3PQ58FF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB3PQ58FF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HSP90AB3PQ58FF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSP90AB3PQ58FF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HSP90AB3PQ58FF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
HSP90AB3PQ58FF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
HSP90AB3PQ58FF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms