Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTBL2Q562R1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTBL2Q562R1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTBL2Q562R1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTBL2Q562R1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBL2Q562R1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBL2Q562R1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBL2Q562R1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTBL2Q562R1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms