Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDA2Q53GA4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHLDA2Q53GA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHLDA2Q53GA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHLDA2Q53GA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHLDA2Q53GA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHLDA2Q53GA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms