Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85BQ15834 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC85BQ15834 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85BQ15834 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85BQ15834 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85BQ15834 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85BQ15834 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85BQ15834 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms