Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRADDQ15628 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRADDQ15628 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRADDQ15628 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRADDQ15628 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRADDQ15628 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRADDQ15628 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRADDQ15628 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRADDQ15628 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRADDQ15628 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRADDQ15628 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRADDQ15628 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRADDQ15628 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRADDQ15628 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRADDQ15628 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRADDQ15628 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRADDQ15628 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRADDQ15628 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRADDQ15628 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRADDQ15628 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRADDQ15628 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRADDQ15628 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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