Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP5Q14008 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP5Q14008 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CKAP5Q14008 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP5Q14008 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP5Q14008 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP5Q14008 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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