Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms