Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMK2BQ13554 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAMK2BQ13554 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMK2BQ13554 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAMK2BQ13554 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMK2BQ13554 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMK2BQ13554 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms