Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLN3Q13286 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLN3Q13286 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLN3Q13286 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLN3Q13286 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLN3Q13286 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLN3Q13286 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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