Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA1Q13136 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA1Q13136 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA1Q13136 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA1Q13136 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA1Q13136 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms