Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB40BQ12829 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB40BQ12829 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40BQ12829 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40BQ12829 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB40BQ12829 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB40BQ12829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB40BQ12829 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB40BQ12829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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