Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 SSL2YIL143C 2532 nt9.4□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 GID8YMR135C 1368 nt9.39□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 ZTA1YBR046C 1005 nt9.39□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 MDM35YKL053C-A 261 nt9.38□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 TSC10YBR265W 963 nt9.38□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 NRT1YOR071C 1797 nt9.37□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 TIR3YIL011W 810 nt9.36□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 URA6YKL024C 615 nt9.36□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 MRS6YOR370C 1812 nt9.35□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 LSC2YGR244C 1284 nt9.35□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 STE4YOR212W 1272 nt9.35□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 NBA1YOL070C 1506 nt9.35□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 DTR1YBR180W 1719 nt9.34□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 PHO23YNL097C 993 nt9.34□□□□□ -0.91
SEC39Q12745 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.33□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 TOK1YJL093C 2076 nt9.33□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YBL086CYBL086C 1401 nt9.32□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 RAD51YER095W 1203 nt9.32□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YGR012WYGR012W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YKL133CYKL133C 1392 nt9.32□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 RIB3YDR487C 627 nt9.31□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 DIG1YPL049C 1359 nt9.31□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 PRO1YDR300C 1287 nt9.3□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YML089CYML089C 369 nt9.3□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 UFD1YGR048W 1086 nt9.29□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 SHH4YLR164W 507 nt9.29□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YLR349WYLR349W 507 nt9.29□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 DAK2YFL053W 1776 nt9.29□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 DIF1YLR437C 402 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 YNR029CYNR029C 1290 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 LSB5YCL034W 1065 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 HIP1YGR191W 1812 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC39Q12745 FUN14YAL008W 597 nt9.27□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 UFO1YML088W 2007 nt9.26□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 ACH1YBL015W 1581 nt9.26□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 ADH7YCR105W 1086 nt9.26□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 AGP3YFL055W 1677 nt9.26□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 TOM6YOR045W 186 nt9.25□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 SPP2YOR148C 558 nt9.25□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 MET28YIR017C 564 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 POM34YLR018C 900 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 LIP1YMR298W 453 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 PET8YNL003C 855 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 LPD1YFL018C 1500 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 YJL195CYJL195C 702 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 PEX2YJL210W 816 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 LSR1LSR1 1175 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 MIM1YOL026C 342 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 OYE3YPL171C 1203 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 FIT3YOR383C 615 nt9.22□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 ATG15YCR068W 1563 nt9.21□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 FIT1YDR534C 1587 nt9.21□□□□□ -0.93
SEC39Q12745 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 TPN1YGL186C 1740 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 VPS62YGR141W 1404 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 RFC1YOR217W 2586 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YHR219WYHR219W 1875 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YPI1YFR003C 468 nt9.19□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 PAU15YIR041W 375 nt9.19□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YDL086WYDL086W 822 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 CWP2YKL096W-A 279 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YLR279WYLR279W 390 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 FMS1YMR020W 1527 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 CAB5YDR196C 726 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 TIF6YPR016C 738 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 TIM44YIL022W 1296 nt9.15□□□□□ -0.94
SEC39Q12745 SED1YDR077W 1017 nt9.14□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 ADH1YOL086C 1047 nt9.14□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 TOA2YKL058W 369 nt9.13□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 HBS1YKR084C 1836 nt9.12□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 LEU9YOR108W 1815 nt9.12□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 YRF1-2YER190W 5046 nt9.11□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 YEL008WYEL008W 381 nt9.11□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 MSB4YOL112W 1479 nt9.1□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 TOM71YHR117W 1920 nt9.09□□□□□ -0.95
SEC39Q12745 GND2YGR256W 1479 nt9.08□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 RPD3YNL330C 1302 nt9.08□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 CPD1YGR247W 720 nt9.08□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 YMR262WYMR262W 942 nt9.08□□□□□ -0.96
SEC39Q12745 BRR1YPR057W 1026 nt9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms