Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.87□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 YLR111WYLR111W 333 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 SEC61YLR378C 1443 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 MUP1YGR055W 1725 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 YPS3YLR121C 1527 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 RSC8YFR037C 1674 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 OPI10YOL032W 741 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 DLD2YDL178W 1593 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 SAM2YDR502C 1155 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 YNL024CYNL024C 741 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 PHO23YNL097C 993 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 SPP2YOR148C 558 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 BNI5YNL166C 1347 nt8.83□□□□□ -1
SNF8Q12483 YMR226CYMR226C 804 nt8.83□□□□□ -1
SNF8Q12483 CCT2YIL142W 1584 nt8.82□□□□□ -1
SNF8Q12483 MSC1YML128C 1542 nt8.82□□□□□ -1
SNF8Q12483 CSM1YCR086W 573 nt8.82□□□□□ -1
SNF8Q12483 PRY1YJL079C 900 nt8.82□□□□□ -1
SNF8Q12483 GND1YHR183W 1470 nt8.81□□□□□ -1
SNF8Q12483 GID7YCL039W 2238 nt8.81□□□□□ -1
SNF8Q12483 SMM1YNR015W 1155 nt8.8□□□□□ -1
SNF8Q12483 LSB6YJL100W 1824 nt8.79□□□□□ -1
SNF8Q12483 FUB1YCR076C 753 nt8.78□□□□□ -1
SNF8Q12483 HEM13YDR044W 987 nt8.78□□□□□ -1
SNF8Q12483 YER188WYER188W 720 nt8.77□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 LOT5YKL183W 921 nt8.76□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 MET2YNL277W 1461 nt8.76□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 COQ8YGL119W 1506 nt8.75□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 ARO8YGL202W 1503 nt8.75□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 SAM3YPL274W 1764 nt8.74□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 VPS62YGR141W 1404 nt8.74□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 RBG2YGR173W 1107 nt8.74□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 YDL086WYDL086W 822 nt8.72□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 YGL114WYGL114W 2178 nt8.72□□□□□ -1.01
SNF8Q12483 RIM8YGL045W 1629 nt8.7□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 NUC1YJL208C 990 nt8.7□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 HXT12YIL170W 1374 nt8.7□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 KES1YPL145C 1305 nt8.69□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 UGP1YKL035W 1500 nt8.69□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 SGA1YIL099W 1650 nt8.69□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 BET2YPR176C 978 nt8.68□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 LSB5YCL034W 1065 nt8.68□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 ZAP1YJL056C 2643 nt8.68□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 OSH7YHR001W 1314 nt8.68□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.67□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 TAT2YOL020W 1779 nt8.67□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 RPT5YOR117W 1305 nt8.66□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 YJL055WYJL055W 738 nt8.66□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 YJL118WYJL118W 660 nt8.66□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 RAS2YNL098C 969 nt8.66□□□□□ -1.02
SNF8Q12483 BSP1YPR171W 1731 nt8.65□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 EAF3YPR023C 1206 nt8.64□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 QDR2YIL121W 1629 nt8.64□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 SOL2YCR073W-A 948 nt8.63□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 YPI1YFR003C 468 nt8.63□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 HIS2YFR025C 1008 nt8.63□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 VRG4YGL225W 1014 nt8.63□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 HEL2YDR266C 1920 nt8.62□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 DIG1YPL049C 1359 nt8.62□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 OYE2YHR179W 1203 nt8.61□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 RIB2YOL066C 1776 nt8.61□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 GAL3YDR009W 1563 nt8.61□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 YNR029CYNR029C 1290 nt8.6□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 TPS1YBR126C 1488 nt8.59□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 YDR455CYDR455C 309 nt8.59□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 GPN2YOR262W 1044 nt8.59□□□□□ -1.03
SNF8Q12483 AIM1YAL046C 357 nt8.58□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 NPP1YCR026C 2229 nt8.57□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 GID8YMR135C 1368 nt8.57□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 SFP1YLR403W 2052 nt8.57□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.56□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.56□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.56□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.56□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 ADH1YOL086C 1047 nt8.56□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 RIB7YBR153W 735 nt8.54□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 MRS6YOR370C 1812 nt8.54□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 YHR219WYHR219W 1875 nt8.53□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 TMA23YMR269W 636 nt8.53□□□□□ -1.04
SNF8Q12483 DDI1YER143W 1287 nt8.52□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 ENT4YLL038C 744 nt8.52□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 ESBP6YNL125C 2022 nt8.52□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 LSM5YER146W 282 nt8.51□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 DLD3YEL071W 1491 nt8.51□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 YKL133CYKL133C 1392 nt8.5□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 YLR046CYLR046C 813 nt8.5□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 SSL2YIL143C 2532 nt8.5□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 ERG13YML126C 1476 nt8.5□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 YMR209CYMR209C 1374 nt8.49□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 SAC7YDR389W 1965 nt8.48□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 IMO32YGR031W 1029 nt8.47□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 RRT8YOL048C 1029 nt8.47□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 ODC1YPL134C 933 nt8.47□□□□□ -1.05
SNF8Q12483 ILV2YMR108W 2064 nt8.45□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 ITR2YOL103W 1830 nt8.45□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 DAK2YFL053W 1776 nt8.44□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 SNZ1YMR096W 894 nt8.44□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 LSR1LSR1 1175 nt8.44□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 CWP2YKL096W-A 279 nt8.43□□□□□ -1.06
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