Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 QDR2YIL121W 1629 nt8.58□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.58□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 UTH1YKR042W 1098 nt8.58□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YSR3YKR053C 1215 nt8.58□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 GTB1YDR221W 2109 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 VPS62YGR141W 1404 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 SBA1YKL117W 651 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YMR103CYMR103C 363 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YPS3YLR121C 1527 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 FLR1YBR008C 1647 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 MEP3YPR138C 1470 nt8.57□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YCR087WYCR087W 516 nt8.56□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 DMA2YNL116W 1569 nt8.56□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YDL086WYDL086W 822 nt8.55□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 DIG1YPL049C 1359 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 RPL4BYDR012W 1089 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 SAM2YDR502C 1155 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 RRT5YFR032C 870 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 CLB6YGR109C 1143 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 RPL4AYBR031W 1089 nt8.54□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 YHL008CYHL008C 1884 nt8.53□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 THI74YDR438W 1113 nt8.53□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 CYT1YOR065W 930 nt8.53□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 ODC1YPL134C 933 nt8.53□□□□□ -1.04
RBD2Q12270 DLD2YDL178W 1593 nt8.52□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 GID8YMR135C 1368 nt8.51□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 TOK1YJL093C 2076 nt8.51□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 OXA1YER154W 1209 nt8.5□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 RPS14BYJL191W 417 nt8.5□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 SSL2YIL143C 2532 nt8.49□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 SEC61YLR378C 1443 nt8.49□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 XYL2YLR070C 1071 nt8.49□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 MRS6YOR370C 1812 nt8.48□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 YHR218WYHR218W 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
RBD2Q12270 HEM13YDR044W 987 nt8.46□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 AIM45YPR004C 1035 nt8.46□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 YKL133CYKL133C 1392 nt8.46□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 UGA4YDL210W 1716 nt8.44□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 YDR094WYDR094W 336 nt8.43□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 HMG2YLR450W 3138 nt8.43□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 YHR219WYHR219W 1875 nt8.43□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 PAU16YKL224C 372 nt8.42□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 TPO4YOR273C 1980 nt8.42□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 YGL034CYGL034C 366 nt8.41□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 YER188WYER188W 720 nt8.4□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 MDM35YKL053C-A 261 nt8.4□□□□□ -1.06
RBD2Q12270 MSF1YPR047W 1410 nt8.39□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 BNI5YNL166C 1347 nt8.39□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 CWP2YKL096W-A 279 nt8.38□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 PHO23YNL097C 993 nt8.38□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 MSC1YML128C 1542 nt8.38□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 FUB1YCR076C 753 nt8.37□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 URA8YJR103W 1737 nt8.37□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 NAT4YMR069W 858 nt8.36□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 HXT10YFL011W 1641 nt8.36□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 FRA1YLL029W 2250 nt8.36□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 OSH7YHR001W 1314 nt8.35□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 AIM1YAL046C 357 nt8.35□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 YLR279WYLR279W 390 nt8.35□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 TSC10YBR265W 963 nt8.35□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 DLD3YEL071W 1491 nt8.34□□□□□ -1.07
RBD2Q12270 APT2YDR441C 546 nt8.33□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 YLR046CYLR046C 813 nt8.32□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 LSR1LSR1 1175 nt8.32□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 TAT2YOL020W 1779 nt8.32□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 YRF1-2YER190W 5046 nt8.32□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 FCY21YER060W 1587 nt8.31□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 GNP1YDR508C 1992 nt8.31□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 MSB4YOL112W 1479 nt8.31□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 RPD3YNL330C 1302 nt8.3□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 ENT4YLL038C 744 nt8.3□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 HXK1YFR053C 1458 nt8.3□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 TIM44YIL022W 1296 nt8.29□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 ALD5YER073W 1563 nt8.29□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 YDR306CYDR306C 1437 nt8.28□□□□□ -1.08
RBD2Q12270 CSM1YCR086W 573 nt8.26□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 RBG1YAL036C 1110 nt8.26□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 YMR262WYMR262W 942 nt8.26□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 AGP3YFL055W 1677 nt8.26□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 ITR2YOL103W 1830 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 SOL2YCR073W-A 948 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 YGR012WYGR012W 1182 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 PCP1YGR101W 1041 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 RAS2YNL098C 969 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 GPN2YOR262W 1044 nt8.25□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 NUC1YJL208C 990 nt8.24□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 VMA11YPL234C 495 nt8.22□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 NBA1YOL070C 1506 nt8.22□□□□□ -1.09
RBD2Q12270 YDR455CYDR455C 309 nt8.21□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 THI72YOR192C 1800 nt8.21□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 RPC31YNL151C 756 nt8.2□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 SDH5YOL071W 489 nt8.2□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 YOR072WYOR072W 315 nt8.2□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 RIM2YBR192W 1134 nt8.2□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 PRY1YJL079C 900 nt8.19□□□□□ -1.1
RBD2Q12270 SAM3YPL274W 1764 nt8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms