Protein–RNA interactions for Protein: Q12259

YLR108C, BTB/POZ domain-containing protein YLR108C, yeastyeast

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR108CQ12259 ALD5YER073W 1563 nt8.2□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 RAD23YEL037C 1197 nt8.18□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 FIT3YOR383C 615 nt8.18□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 URA6YKL024C 615 nt8.17□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 YLR279WYLR279W 390 nt8.17□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 YGR012WYGR012W 1182 nt8.16□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 YHR218WYHR218W 1812 nt8.16□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 YBL086CYBL086C 1401 nt8.16□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 SDH5YOL071W 489 nt8.16□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 CAB5YDR196C 726 nt8.15□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 YAR028WYAR028W 705 nt8.15□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 ODC1YPL134C 933 nt8.15□□□□□ -1.1
YLR108CQ12259 MTG2YHR168W 1557 nt8.14□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 YLR111WYLR111W 333 nt8.14□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.13□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 RSC4YKR008W 1878 nt8.13□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 LIP1YMR298W 453 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 MSB4YOL112W 1479 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 QDR2YIL121W 1629 nt8.11□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 UFO1YML088W 2007 nt8.11□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 ALP1YNL270C 1722 nt8.11□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 RIB3YDR487C 627 nt8.1□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 ZTA1YBR046C 1005 nt8.1□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 MCM5YLR274W 2328 nt8.1□□□□□ -1.11
YLR108CQ12259 GAL2YLR081W 1725 nt8.08□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 PCP1YGR101W 1041 nt8.07□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 PET8YNL003C 855 nt8.07□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YOR072WYOR072W 315 nt8.07□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 SED1YDR077W 1017 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 OYE3YPL171C 1203 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 GTB1YDR221W 2109 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 GID8YMR135C 1368 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 SSL2YIL143C 2532 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 SAM1YLR180W 1149 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 AKR2YOR034C 2250 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 ACH1YBL015W 1581 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 SPP2YOR148C 558 nt8.04□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 MEP3YPR138C 1470 nt8.04□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 DIG1YPL049C 1359 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 LEU9YOR108W 1815 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 MRS6YOR370C 1812 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 HXT10YFL011W 1641 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR108CQ12259 MAS1YLR163C 1389 nt8.02□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.02□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 VPS62YGR141W 1404 nt8.02□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 MDM35YKL053C-A 261 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 TOA2YKL058W 369 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 THI72YOR192C 1800 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 YKL133CYKL133C 1392 nt8□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 FMS1YMR020W 1527 nt8□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 FCY21YER060W 1587 nt8□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 YDL086WYDL086W 822 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 TOK1YJL093C 2076 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 BRR1YPR057W 1026 nt7.98□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 GND1YHR183W 1470 nt7.98□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 GND2YGR256W 1479 nt7.96□□□□□ -1.13
YLR108CQ12259 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 MEX67YPL169C 1800 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 APT2YDR441C 546 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 PHO23YNL097C 993 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 YPL251WYPL251W 303 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 LOT5YKL183W 921 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 YPS3YLR121C 1527 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 NBA1YOL070C 1506 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 YHR219WYHR219W 1875 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 CWP2YKL096W-A 279 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 SMM1YNR015W 1155 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 FLR1YBR008C 1647 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 MDL2YPL270W 2322 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 YRF1-2YER190W 5046 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 SAM2YDR502C 1155 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 YPI1YFR003C 468 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 LSR1LSR1 1175 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR108CQ12259 AGP3YFL055W 1677 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 ADH1YOL086C 1047 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 TIM44YIL022W 1296 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 PRY1YJL079C 900 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 YNR029CYNR029C 1290 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 MTO1YGL236C 2010 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 YMR103CYMR103C 363 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 HXT12YIL170W 1374 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 DLD2YDL178W 1593 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR108CQ12259 FRA1YLL029W 2250 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 RPD3YNL330C 1302 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 CSM1YCR086W 573 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 FUN14YAL008W 597 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 YJL195CYJL195C 702 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 YMR262WYMR262W 942 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 DLD3YEL071W 1491 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 MIM1YOL026C 342 nt7.8□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 HEM13YDR044W 987 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR108CQ12259 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 220.8 ms