Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YBL086CYBL086C 1401 nt11.88□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 TOA2YKL058W 369 nt11.88□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 RPT5YOR117W 1305 nt11.86□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 PAR32YDL173W 888 nt11.86□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 DBP1YPL119C 1854 nt11.86□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 SSN3YPL042C 1668 nt11.85□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 NUC1YJL208C 990 nt11.85□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 RIB7YBR153W 735 nt11.85□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 TUB4YLR212C 1422 nt11.85□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 SAM3YPL274W 1764 nt11.84□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 LEU9YOR108W 1815 nt11.84□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 PRP4YPR178W 1398 nt11.84□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 SOD2YHR008C 702 nt11.84□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 IRC24YIR036C 792 nt11.84□□□□□ -0.51
SLM3Q12093 HXT1YHR094C 1713 nt11.83□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 BNI5YNL166C 1347 nt11.82□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 GND2YGR256W 1479 nt11.81□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 YIA6YIL006W 1122 nt11.8□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 POT1YIL160C 1254 nt11.8□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 APS2YJR058C 444 nt11.78□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 HIF1YLL022C 1158 nt11.78□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 GSF2YML048W 1212 nt11.78□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 MHF1YOL086W-A 273 nt11.78□□□□□ -0.52
SLM3Q12093 BMT6YLR063W 1098 nt11.77□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 DPS1YLL018C 1674 nt11.75□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 PHO23YNL097C 993 nt11.75□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 YPR126CYPR126C 309 nt11.75□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 TPS1YBR126C 1488 nt11.75□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 CTI6YPL181W 1521 nt11.75□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.72□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 MSC1YML128C 1542 nt11.71□□□□□ -0.53
SLM3Q12093 NIF3YGL221C 867 nt11.68□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 RAS2YNL098C 969 nt11.67□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 SAM2YDR502C 1155 nt11.66□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 IML3YBR107C 738 nt11.66□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 DAK2YFL053W 1776 nt11.66□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 OYE2YHR179W 1203 nt11.65□□□□□ -0.54
SLM3Q12093 UFO1YML088W 2007 nt11.64□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 SHY1YGR112W 1170 nt11.64□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 SAM50YNL026W 1455 nt11.63□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 SEC61YLR378C 1443 nt11.63□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 YCP4YCR004C 744 nt11.63□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 POP2YNR052C 1302 nt11.61□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 FUB1YCR076C 753 nt11.61□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 IGD1YFR017C 588 nt11.61□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.6□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 YNL024CYNL024C 741 nt11.6□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 EAF3YPR023C 1206 nt11.6□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 QDR2YIL121W 1629 nt11.59□□□□□ -0.55
SLM3Q12093 YER188WYER188W 720 nt11.58□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 OXA1YER154W 1209 nt11.57□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 OYE3YPL171C 1203 nt11.57□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 SNF1YDR477W 1902 nt11.55□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 KRE1YNL322C 942 nt11.55□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 YCR025CYCR025C 411 nt11.53□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 TMA23YMR269W 636 nt11.53□□□□□ -0.56
SLM3Q12093 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 DDI1YER143W 1287 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 URA6YKL024C 615 nt11.52□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 IPL1YPL209C 1104 nt11.51□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 ACO2YJL200C 2370 nt11.5□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 BUD20YLR074C 501 nt11.5□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 PET8YNL003C 855 nt11.48□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 DLD2YDL178W 1593 nt11.47□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 LSM5YER146W 282 nt11.47□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 FLR1YBR008C 1647 nt11.46□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 CDD1YLR245C 429 nt11.46□□□□□ -0.57
SLM3Q12093 LYS20YDL182W 1287 nt11.45□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 SPS100YHR139C 981 nt11.45□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 NAS2YIL007C 663 nt11.45□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 IMO32YGR031W 1029 nt11.43□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 OSH7YHR001W 1314 nt11.42□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.42□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 SOL2YCR073W-A 948 nt11.41□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 SWM1YDR260C 513 nt11.41□□□□□ -0.58
SLM3Q12093 RSC8YFR037C 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
SLM3Q12093 YJL225CYJL225C 5277 nt11.36□□□□□ -0.59
SLM3Q12093 YPS3YLR121C 1527 nt11.35□□□□□ -0.59
SLM3Q12093 FLX1YIL134W 936 nt11.35□□□□□ -0.59
SLM3Q12093 SPE2YOL052C 1191 nt11.34□□□□□ -0.59
SLM3Q12093 ZRT3YKL175W 1512 nt11.33□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 FMS1YMR020W 1527 nt11.33□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 BOR1YNL275W 1731 nt11.32□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 PAC11YDR488C 1602 nt11.32□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 HEM13YDR044W 987 nt11.32□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 YDR455CYDR455C 309 nt11.32□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 ABZ2YMR289W 1125 nt11.31□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 YMR007WYMR007W 381 nt11.3□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 TAT2YOL020W 1779 nt11.3□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 ADE8YDR408C 645 nt11.29□□□□□ -0.6
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