Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 VRG4YGL225W 1014 nt10.95□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 YJL195CYJL195C 702 nt10.95□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 RIB2YOL066C 1776 nt10.95□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 BNI5YNL166C 1347 nt10.94□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 YJL055WYJL055W 738 nt10.93□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 SEC61YLR378C 1443 nt10.92□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 HXT12YIL170W 1374 nt10.92□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 GID7YCL039W 2238 nt10.91□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 NUC1YJL208C 990 nt10.9□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 PHO23YNL097C 993 nt10.9□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 LSB5YCL034W 1065 nt10.9□□□□□ -0.66
BRE1Q07457 INA1YLR413W 2028 nt10.89□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 MSC1YML128C 1542 nt10.89□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 OXA1YER154W 1209 nt10.88□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 FUN14YAL008W 597 nt10.87□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 CWC15YDR163W 528 nt10.86□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 FLR1YBR008C 1647 nt10.85□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 YER188WYER188W 720 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 DLD2YDL178W 1593 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 RSC8YFR037C 1674 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 RPT5YOR117W 1305 nt10.84□□□□□ -0.67
BRE1Q07457 FUB1YCR076C 753 nt10.83□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 YJL118WYJL118W 660 nt10.83□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 FMS1YMR020W 1527 nt10.83□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 ESBP6YNL125C 2022 nt10.82□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 RPC82YPR190C 1965 nt10.82□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 SAM3YPL274W 1764 nt10.82□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 RAS2YNL098C 969 nt10.81□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 SPP2YOR148C 558 nt10.81□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 STE4YOR212W 1272 nt10.81□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.8□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.8□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 YPS3YLR121C 1527 nt10.8□□□□□ -0.68
BRE1Q07457 YEL008WYEL008W 381 nt10.77□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 GAL3YDR009W 1563 nt10.76□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 RAD51YER095W 1203 nt10.74□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 YLR349WYLR349W 507 nt10.74□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 RIB7YBR153W 735 nt10.74□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 OYE2YHR179W 1203 nt10.73□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 OSH7YHR001W 1314 nt10.73□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 TPS1YBR126C 1488 nt10.73□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 ACH1YBL015W 1581 nt10.73□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 SPT20YOL148C 1815 nt10.72□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.72□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 HEM13YDR044W 987 nt10.71□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 EAF3YPR023C 1206 nt10.71□□□□□ -0.69
BRE1Q07457 VPS62YGR141W 1404 nt10.69□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 GPN2YOR262W 1044 nt10.69□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 CMP2YML057W 1815 nt10.69□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 MCM5YLR274W 2328 nt10.69□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 SOL2YCR073W-A 948 nt10.67□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 YOR325WYOR325W 474 nt10.66□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 CCT5YJR064W 1689 nt10.66□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 ADH7YCR105W 1086 nt10.65□□□□□ -0.7
BRE1Q07457 ILV3YJR016C 1758 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 LSM5YER146W 282 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 CPD1YGR247W 720 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 RFC1YOR217W 2586 nt10.63□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 TAT2YOL020W 1779 nt10.62□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 YDL086WYDL086W 822 nt10.62□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 PAU15YIR041W 375 nt10.62□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 CCT2YIL142W 1584 nt10.61□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 DDI1YER143W 1287 nt10.61□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 HEM14YER014W 1620 nt10.6□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 SNZ1YMR096W 894 nt10.6□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 YNL024CYNL024C 741 nt10.6□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 TMA23YMR269W 636 nt10.59□□□□□ -0.71
BRE1Q07457 OPI10YOL032W 741 nt10.58□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 DTR1YBR180W 1719 nt10.58□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 THI72YOR192C 1800 nt10.57□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 YDR455CYDR455C 309 nt10.57□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.56□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.56□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.56□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.56□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 MAS1YLR163C 1389 nt10.55□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 MUP1YGR055W 1725 nt10.55□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 DAK2YFL053W 1776 nt10.54□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 YPR126CYPR126C 309 nt10.54□□□□□ -0.72
BRE1Q07457 IMO32YGR031W 1029 nt10.52□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 ILV2YMR108W 2064 nt10.51□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 AIM1YAL046C 357 nt10.5□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 TAF13YML098W 504 nt10.5□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 LSB6YJL100W 1824 nt10.49□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 CTI6YPL181W 1521 nt10.48□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 BET2YPR176C 978 nt10.48□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 IML3YBR107C 738 nt10.48□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 ERG13YML126C 1476 nt10.48□□□□□ -0.73
BRE1Q07457 ARO8YGL202W 1503 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 RRT8YOL048C 1029 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 NPP1YCR026C 2229 nt10.45□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 QDR2YIL121W 1629 nt10.44□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 DIG1YPL049C 1359 nt10.44□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.44□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 MHF1YOL086W-A 273 nt10.44□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 HOL1YNR055C 1761 nt10.44□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 ADE8YDR408C 645 nt10.42□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.42□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 POT1YIL160C 1254 nt10.42□□□□□ -0.74
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