Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF9Q07011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF9Q07011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF9Q07011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF9Q07011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF9Q07011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms