Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tff2Q03404 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tff2Q03404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tff2Q03404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tff2Q03404 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tff2Q03404 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tff2Q03404 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tff2Q03404 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tff2Q03404 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tff2Q03404 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tff2Q03404 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tff2Q03404 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tff2Q03404 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tff2Q03404 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tff2Q03404 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tff2Q03404 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tff2Q03404 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tff2Q03404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tff2Q03404 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tff2Q03404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tff2Q03404 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tff2Q03404 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms