Protein–RNA interactions for Protein: Q02574

MEC3, DNA damage checkpoint control protein MEC3, yeastyeast

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MEC3Q02574 PAR32YDL173W 888 nt11.7□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 DPS1YLL018C 1674 nt11.69□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 YJL118WYJL118W 660 nt11.69□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 RIB7YBR153W 735 nt11.69□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 NUC1YJL208C 990 nt11.68□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 YMR103CYMR103C 363 nt11.68□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 YMR262WYMR262W 942 nt11.68□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 TIP1YBR067C 633 nt11.68□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 BRR1YPR057W 1026 nt11.68□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 GAL3YDR009W 1563 nt11.67□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 RPT5YOR117W 1305 nt11.66□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 TOA2YKL058W 369 nt11.66□□□□□ -0.54
MEC3Q02574 HXT1YHR094C 1713 nt11.63□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 YBL086CYBL086C 1401 nt11.62□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 DBP1YPL119C 1854 nt11.62□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 IRC24YIR036C 792 nt11.62□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 LEU9YOR108W 1815 nt11.62□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 SSN3YPL042C 1668 nt11.62□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 SOD2YHR008C 702 nt11.61□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 ERG6YML008C 1152 nt11.61□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 GSF2YML048W 1212 nt11.61□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 YGR139WYGR139W 339 nt11.6□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 YIA6YIL006W 1122 nt11.6□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 POT1YIL160C 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 HIF1YLL022C 1158 nt11.6□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 NME1NME1 340 nt11.6□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 MHF1YOL086W-A 273 nt11.59□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 TUB4YLR212C 1422 nt11.59□□□□□ -0.55
MEC3Q02574 SNZ1YMR096W 894 nt11.57□□□□□ -0.56
MEC3Q02574 PHO23YNL097C 993 nt11.55□□□□□ -0.56
MEC3Q02574 BNI5YNL166C 1347 nt11.55□□□□□ -0.56
MEC3Q02574 GND2YGR256W 1479 nt11.53□□□□□ -0.56
MEC3Q02574 SAM3YPL274W 1764 nt11.53□□□□□ -0.56
MEC3Q02574 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.52□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 YPR126CYPR126C 309 nt11.51□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 SAM2YDR502C 1155 nt11.5□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 MSC1YML128C 1542 nt11.5□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 CTI6YPL181W 1521 nt11.49□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 IML3YBR107C 738 nt11.48□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 SEC61YLR378C 1443 nt11.47□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 APS2YJR058C 444 nt11.47□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 SNF1YDR477W 1902 nt11.47□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 BOR1YNL275W 1731 nt11.46□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 TPS1YBR126C 1488 nt11.46□□□□□ -0.57
MEC3Q02574 YCP4YCR004C 744 nt11.44□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 OYE2YHR179W 1203 nt11.44□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 RAS2YNL098C 969 nt11.44□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 YNL024CYNL024C 741 nt11.43□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 DAK2YFL053W 1776 nt11.43□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 OXA1YER154W 1209 nt11.41□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 QDR2YIL121W 1629 nt11.4□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 SHY1YGR112W 1170 nt11.4□□□□□ -0.58
MEC3Q02574 NIF3YGL221C 867 nt11.39□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 UFO1YML088W 2007 nt11.38□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 POP2YNR052C 1302 nt11.38□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 YER188WYER188W 720 nt11.38□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 IGD1YFR017C 588 nt11.37□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 SAM50YNL026W 1455 nt11.37□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 FUB1YCR076C 753 nt11.35□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 OYE3YPL171C 1203 nt11.35□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 EAF3YPR023C 1206 nt11.35□□□□□ -0.59
MEC3Q02574 YCR025CYCR025C 411 nt11.33□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 URA6YKL024C 615 nt11.33□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.32□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 PET8YNL003C 855 nt11.31□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 ACO2YJL200C 2370 nt11.31□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 UME6YDR207C 2511 nt11.28□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 TMA23YMR269W 636 nt11.28□□□□□ -0.6
MEC3Q02574 KRE1YNL322C 942 nt11.27□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 IPL1YPL209C 1104 nt11.27□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.25□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 OSH7YHR001W 1314 nt11.24□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 BIO5YNR056C 1686 nt11.24□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 DDI1YER143W 1287 nt11.23□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 SPS100YHR139C 981 nt11.23□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 BUD20YLR074C 501 nt11.23□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 DLD2YDL178W 1593 nt11.23□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 LSM5YER146W 282 nt11.22□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 IMO32YGR031W 1029 nt11.21□□□□□ -0.61
MEC3Q02574 ZRT3YKL175W 1512 nt11.2□□□□□ -0.62
MEC3Q02574 SOL2YCR073W-A 948 nt11.17□□□□□ -0.62
MEC3Q02574 FLR1YBR008C 1647 nt11.17□□□□□ -0.62
MEC3Q02574 LYS20YDL182W 1287 nt11.15□□□□□ -0.62
MEC3Q02574 SWM1YDR260C 513 nt11.14□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 RSC8YFR037C 1674 nt11.14□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 NAS2YIL007C 663 nt11.13□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 YMR007WYMR007W 381 nt11.13□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 FLX1YIL134W 936 nt11.12□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 RCR1YBR005W 642 nt11.12□□□□□ -0.63
MEC3Q02574 CDD1YLR245C 429 nt11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 105 ms