Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMP22Q01453 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMP22Q01453 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMP22Q01453 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMP22Q01453 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMP22Q01453 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMP22Q01453 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMP22Q01453 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms