Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Nbr1P97432 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nbr1P97432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nbr1P97432 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Nbr1P97432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nbr1P97432 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Nbr1P97432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Nbr1P97432 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Nbr1P97432 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,3 ms