Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nbr1P97432 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nbr1P97432 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nbr1P97432 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nbr1P97432 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nbr1P97432 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nbr1P97432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nbr1P97432 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nbr1P97432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nbr1P97432 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nbr1P97432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nbr1P97432 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nbr1P97432 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms