Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG7P83436 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG7P83436 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG7P83436 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG7P83436 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG7P83436 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG7P83436 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG7P83436 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG7P83436 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COG7P83436 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG7P83436 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG7P83436 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG7P83436 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG7P83436 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG7P83436 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG7P83436 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG7P83436 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG7P83436 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG7P83436 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG7P83436 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG7P83436 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG7P83436 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG7P83436 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG7P83436 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG7P83436 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG7P83436 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG7P83436 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG7P83436 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG7P83436 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COG7P83436 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG7P83436 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG7P83436 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG7P83436 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG7P83436 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG7P83436 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG7P83436 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG7P83436 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG7P83436 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG7P83436 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG7P83436 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG7P83436 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG7P83436 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG7P83436 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG7P83436 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG7P83436 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG7P83436 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG7P83436 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG7P83436 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG7P83436 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG7P83436 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG7P83436 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG7P83436 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG7P83436 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG7P83436 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG7P83436 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG7P83436 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG7P83436 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG7P83436 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG7P83436 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG7P83436 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG7P83436 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG7P83436 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG7P83436 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG7P83436 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG7P83436 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG7P83436 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG7P83436 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG7P83436 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG7P83436 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG7P83436 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG7P83436 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG7P83436 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG7P83436 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COG7P83436 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG7P83436 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG7P83436 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG7P83436 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG7P83436 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG7P83436 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG7P83436 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG7P83436 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG7P83436 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COG7P83436 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG7P83436 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG7P83436 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG7P83436 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG7P83436 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG7P83436 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COG7P83436 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COG7P83436 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG7P83436 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG7P83436 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms