Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS11P82912 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS11P82912 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS11P82912 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS11P82912 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS11P82912 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms